Pulau Onrust terdapat peninggalan Belanda berupa galangan kapal dan Benteng Martello yang digunakan untuk perbaikan kapal dan sebagai benteng pertahanan sebelum masuk batavia.
Pulau Cipir yang juga sering disebut dengan Pulau Kahyangan terdapat peninggalan sejarah, yaitu sisa sebuah rumah sakit untuk haji pada zaman nenek moyang kita dahulu, reruntuhan bangunan yang dibangun pada zaman VOC dan meriam kuno yang umurnya berabad-abad tahun
Sedangkan di Pulau Kelor terdapat pula Benteng Martello yang masih utuh, di taman Arkeologi Onrust juga terdapat sisa runtuhan karantina haji tahun 1911, makam keramat Kartosoewirjo, Benda Cagar Budaya. Pada tahun 1930-an, Pulau Onrust juga menjadi asrama haji sebelum diberangkatkan ke Arab Saudi.